La carrera contra las variantes del SARS-CoV-2

La pandemia de COVID-19 en curso ha tenido un devastador impacto en la salud pública, en la economía y la sociedad. Se han suministrado vacunas eficaces, desarrolladas a un ritmo sin precedentes, en un esfuerzo por frenar la propagación del SARS-CoV-2. Actualmente, hay 4 tipos principales de vacunas frente a la COVID-19 (que se han aprobados para su uso o que están en desarrollo): mRNA, vector viral, subunidad proteica y vacunas basadas en virus inactivados.

La mayor parte del esfuerzo mundial de vacunación se centra en las vacunas basadas en ARNm BNT162b2 y ARNm-1273 desarrolladas por Pfizer-BioNTech y Moderna, respectivamente, y en las vacunas basadas en vectores virales, ChAdOx1 nCoV-19 y Ad26.COV2.S, desarrolladas por AstraZeneca y Johnson & Johnson / Janssen, respectivamente. Todos codifican la proteína SARS-CoV-2 Spike (S) y tienen como objetivo prevenir la enfermedad principalmente desencadenando la producción de anticuerpos neutralizantes que bloquean la proteína S y, por tanto, inhiben la entrada virus.

Estas vacunas se diseñaron en base a la proteína S de la cepa original del SARS-CoV-2 que circulaba temprano en la pandemia. Sin embargo, han surgido varias variantes de preocupación (VOC – variants of concern) y variantes de interés (VOI – variants of interest). Por tanto, la pregunta es: ¿estas variantes pondrán en peligro la eficacia de las vacunas recién introducidas?

Las VOC (variants of concern) circulantes se identificaron por primera vez en el Reino Unido (B.1.1.7, Alpha), Sudáfrica (B.1.351, Beta), Brasil (P.1, Gamma) e India (B.1.617.2, Delta). Se identificaron por primera vez más VOI (variants of interest) en los Estados Unidos (B.1.429, Epsilon y B.1.526, Iota) e India (B.1.617.1, Kappa). Ver tabla siguiente:

Las VOC y VOI se caracterizan por mutaciones y/o deleciones dentro de la región codificante S. Varias de estas mutaciones se ha demostrado que aumentan la transmisibilidad aumentando la unión al receptor ACE2 del huésped (p. ej., D614G y N501Y) y/o ayuda en la evasión inmunológica al alterar los epítopos de los anticuerpos neutralizantes. (por ejemplo, K417N / T, L452R y E484K / Q)

Muchas de estas mutaciones se observan dentro del dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína S. Esto es bastante preocupante considerando que los análisis serológicos de individuos infectados con SARS-CoV-2 han indicado que la principal actividad de los anticuerpos séricos se dirige al RBD5.


Más información con respecto a esta línea de investigación podrá leerla en el articulo original en inglés:


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Anti-Spikedetectionassays
ELISA and LIPS:
SpikeRBD-Luciaproteins
Flowcytometry(FACS):
REGN-10933&REGN-10987-derivedantibodies
LY-CoV555&LY-CoV016-derivedantibodies
Spike(S)andS-derivedCodingSequences

NeutralizationAssays
Spike-pseudotypedlentiviralinfection:
pLV-Spikeplasmids
A549-hACE2-TMPRSS2Cells
HEK-Blue™hACE2-TMPRSS2Cells
Spike-ACE2dependentcellfusion:
pUNO1-Spikeplasmids
293-hMyD88Cells
HEK-Blue™hACE2Cells
A549-Dual™hACE2-TMPRSS2Cells


COVID-19-RELATED GENES

SARS-CoV-2 Cellular Receptor GenesSARS-CoV-2 Structural GenesSARS-CoV-2 Spike pseudotyping plasmids NEW

COVID-19-RELATED CELL LINES

293-SARS2-S Cells NEW293-SARS2-S-dfur Cells NEW293-hMyD88 Cells NEWHEK-Blue™ hACE2(-TMPRSS2) Cells NEWA549-hACE2-(TMPRSS2) Cells NEWA549-Dual™ (KO-MDA5 or KO-RIG-I) hACE2-TMPRSS2 Cells NEWHEK-Blue™ ISG CellsHEK-Blue™ IL-6 CellsHEK-Blue™ IL-1β CellsHEK-Blue™ TNF-α Cells

COVID-19-RELATED PROTEINS

Spike-S1Spike-RBDNucleocapsidHuman ACE2Spike variant RBD-Lucia NEW

​COVID-19-RELATED ANTIBODIES

Anti-SARS-CoV Spike mAbs (CR3022-derived)Anti-SARS-CoV-2 Spike mAb (H4-derived) NEWAnti-SARS-CoV-2 Spike mAb (B38-derived) NEWAnti-SARS-CoV-2 Spike mAbs (REGN-10933 & REGN-10987-derived) NEWAnti-SARS-CoV-2 Spike mAbs (LY-CoV555 & LY-CoV016-derived) NEWAnti-SARS-CoV Nucleocapsid mAb (CR3018-derived) NEWAnti-hIL6R mabs (Tocilizumab-derived)Anti-hACE2 mouse IgG2b NEW

​COVID-19-RELATED INHIBITORS

Remdesivir (Viral RdRp Inhibitor)Ruxolitinib (JAK/STAT Signaling Inhibitors)Chloroquine (Endosomal Acidification Inhibitors)Bafilomycin A1 (Endosomal Acidification Inhibitors)

OTHER COVID-19-RELATED PRODUCTS

Poly(I:C) (Type I IFN Inducers)3p-hpRNA (Type I IFN Inducers)pFUSE-Fc plasmids (Fc-Fusion)pFUSE (Antibody Generation)pTRIOZ (Antibody Generation)Vaccine Adjuvants : Alum, emulsions, and PRR agonists